Фамилия Поногоркин — редкая и морфологически прозрачная, хотя её основа на первый взгляд кажется тёмной. Разберём её по составу: корень «Поногорк-», суффикс «-ин». Суффикс «-ин» в русских фамилиях традиционно указывает на принадлежность: «чей сын?» — Поногоркин, то есть сын Поногорки. Значит, исходным было личное прозвище или некалендарное имя Поногорка.

Ключевой вопрос — что означало это прозвище. Самая вероятная версия: оно образовано от словосочетания «по ногорку» или «по нагорку». В диалектах «ногорок» — вариант слова «нагорок» (небольшой холм, возвышенность). Прозвище Поногорка могли дать человеку, жившему «по нагорку» — на склоне, у холма или за ним. Это типичная модель для русских прозвищ, описывающих место жительства: ср. Загорка, Подгорка, Нагорка. Приставка «по-» здесь указывает на расположение вдоль или около объекта.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным глаголом «поногоркать» (говорить с присвистом, картавить или гнусавить). В таком случае прозвище могло относиться к манере речи. Однако эта версия слабее: глагол редок и не фиксируется в основных словарях русских говоров так широко, как топографическая лексика. География фамилии тоже подсказывает: Поногоркины встречаются в основном в бывших Пермской и Вятской губерниях, где «нагорок» — обычное слово для обозначения пригорка. В этих краях фамилии с суффиксом «-ин» от прозвищ на «-ка» — массовое явление (Злобин, Широкин, Кривоногкин).

Таким образом, предок носителей фамилии Поногоркин с большой вероятностью получил прозвище от места жительства на взгорье. Фамилия сохранила архаичную диалектную форму, где приставка «по-» слилась с корнем, а суффикс «-к-» придал прозвищу уменьшительно-бытовой оттенок. В современных справочниках по ономастике фамилия не описана, но её разбор по модели Унбегауна (фамилии на «-ин» от прозвищ) не оставляет сомнений в словообразовательной логике.