Фамилия Пономарицын — редкий пример того, как церковная должность превратилась в фамилию с неожиданным суффиксом. В основе лежит слово «пономарь» — так называли церковнослужителя низшего чина, который помогал при богослужении, звонил в колокола и следил за порядком в храме. Само слово пришло из греческого «парамонариос» (приставленный к помещению), но в русском языке оно быстро обросло бытовыми оттенками: пономарей часто называли «пономарями» или «пономаришками», а их обязанности считались малопрестижными.

Что сразу бросается в глаза — это окончание «-цын». Обычно фамилии от профессий образуются с суффиксами «-ов» или «-ев» (Пономарев, Пономаренко). Вариант Пономарицын встречается гораздо реже. Суффикс «-цын» (или «-ин» с перегласовкой корня) указывает на принадлежность: «чей?» — пономарицын, то есть сын пономаря или человек из семьи пономаря. Такая модель чаще работала с прозвищами, оканчивающимися на «-а» или «-я» (Кузьмин от Кузьма), но в случае с Пономарицыным произошло нечто иное: форму «пономарь» сперва переделали в разговорное «Пономаря» или «Пономарица» (как ласкательное или презрительное), а от него уже образовали фамилию. Иначе говоря, Пономарицын — это не «сын пономаря» напрямую, а «сын того, кого звали Пономарицей».

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России — Вологодской, Костромской, Вятской. Там приходские храмы были многочисленны, и прозвища, связанные с церковной службой, закреплялись за целыми династиями. В отличие от фамилии Пономарев, которая встречается повсеместно, Пономарицын осталась локальным вариантом — её носители, скорее всего, происходят из одного компактного региона, где «пономарица» было местным словом.

Ударение в фамилии — на второй слог: Понома́рицын. Это отличает её от фамилий на «-ицын» с ударением на третий слог (например, Голи́цын). Короткая справка: в дореволюционных метрических книгах можно встретить написание «Пономарицынъ» с твёрдым знаком, а также искажённые формы — «Понамарицын», «Пономорецын». Но исходный вариант один: от пономаря, который в народе мог получить прозвище Пономарица.