Фамилия Попинанченко звучит необычно, и её разбор стоит начать с суффикса, который выдаёт украинское или южнорусское происхождение. Модель на -енко (с наращением -ан- перед суффиксом) — классическая для украинской антропонимии, особенно для фамилий, образованных от прозвищ. Если бы фамилия была русской, она скорее всего выглядела бы как Попинанов или Попинкин. Аналог по структуре — фамилии вроде Бурлаченко, Колесниченко, где основа усложнена перед суффиксом.

Основа Попинан- ведёт к слову «поп» (священник). Однако это не прямая фамилия от «поп» (как Попов), а производное от более сложного прозвища. Скорее всего, в основе лежит глагол «попинать» — в южных говорах это означает «пнуть», «толкнуть ногой» или, в переносном смысле, «обидеть», «погонять». Прозвище Попинанец могли дать человеку за драчливый нрав, за привычку задевать окружающих, или же, наоборот, за то, что его самого постоянно «пинали» — обижали и помыкали им. В любом случае, это прозвище из разряда бытовых, описывающих характер или поведение.

Вторая, менее вероятная версия — связь с именем Попина (женская форма от Поп) или с названием какого-то местного обычая. Но глагольная основа выглядит убедительнее, тем более что в украинских фамилиях суффикс -ан- часто присоединяется именно к глагольным корням (ср. Гулянченко от «гулять», Стуканченко от «стукать»).

Географически фамилия привязана к центральной и восточной Украине, а также к приграничным областям России (Курская, Белгородская, Воронежская области), куда в XVII–XVIII веках переселялись украинские казаки и крестьяне. Попинанченко — фамилия преимущественно крестьянская или казацкая, без дворянских корней. Носители её, скорее всего, были людьми недуховного звания — ремесленниками, хлеборобами или служилыми людьми, получившими прозвище за живой и, возможно, задиристый характер.