Фамилия Повоинская — редкий пример, где географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную версию. Это типичная «ская»-фамилия, образованная по польско-украинской модели от названия населённого пункта. Суффикс -ск-/-цк- указывает на дворянское или шляхетское происхождение носителя: так в Речи Посполитой и на западе Российской империи оформляли фамилии землевладельцев или людей, переселившихся из определённого места.

Основа «Повоин» — скорее всего, топоним. Можно предположить, что существовало или существует село Повоино (или Повоинь, Повойна). Название такого села могло произойти от древнерусского «воин» — ратник, дружинник. Приставка «по-» в топонимике часто означала «вдоль» или «по берегу» (реки Воини, Воинки) либо «после, около» (село, основанное после воина или на месте воинского стана). В любом случае, семантика связана с военным делом: первый владелец поместья Повоино мог получить землю за службу, или само поселение выросло вокруг сторожевого поста.

Версия, что фамилия произошла напрямую от прозвища Повоин (человек, который «по воинской части» — сын воина, либо тот, кто «повоевал»), менее вероятна. В русской традиции прозвища с приставкой «по-» редки и обычно означают подобие («по-медвежьи», «по-собачьи»), а не происхождение. Кроме того, у фамилий на -ский крайне редко бывает прозвищная основа — они почти всегда топонимические.

С точки зрения сословной истории, фамилия Повоинская могла принадлежать мелкопоместной шляхте или однодворцам — потомкам служилых людей, которые после разделов Польши оказались на русской службе. Встречаемость фамилии крайне низкая, в современных справочниках она не фиксируется как массовая. Это говорит о том, что род, вероятно, был немногочисленным и локальным, возможно, угас или сменил фамилию в XX веке. Написание с двумя «н» в суффиксе (-инская, а не -инская) — норма для притяжательных форм от основ на -ин, здесь оно указывает на исходный топоним мужского рода (Повоино → Повоинский → Повоинская).