Фамилия Пожемяцкас — редкий для русского уха пример литовского антропонима. Её выдают суффикс и окончание: типичное литовское -ас (-as) указывает на именительный падеж мужского рода. В Литве такие фамилии образуют целый пласт, и Пожемяцкас здесь не исключение.

Корень фамилии — «пожемяц-». Скорее всего, он восходит к литовскому слову «pažemė» (низина, низменность) или «pažemys» (низкое место). Приставка «po-» в литовском языке часто означает «под», «при», «около». Таким образом, Пожемяцкас — это «тот, кто живёт у низины» или «обитатель низменности». Вероятно, прозвище закрепилось за человеком, чей дом стоял в низине, у болота или в пойме реки. Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с личным именем Жемайтис (Žemaitis) — житель Жемайтии, исторической области на западе Литвы. В таком случае Пожемяцкас мог означать «потомок жемайта», но форма с приставкой «по-» для этой модели нехарактерна.

По словообразовательной модели фамилия относится к группе оттопонимических или прозвищных фамилий на -ас. В Литве такие фамилии не указывали на сословную принадлежность: их носили и крестьяне, и мелкопоместные шляхтичи, особенно в Жемайтии и Аукштайтии. В русских документах XIX — начала XX века фамилию могли записывать как Пожемяцкий или Пожемятский, подгоняя под славянское окончание, но исходная форма сохранилась у носителей, эмигрировавших или оставшихся в Литве.

Встречаемость фамилии крайне низкая. За пределами Литвы её можно найти среди литовской диаспоры в США, Великобритании и, реже, в России — как след переселения литовцев в XIX веке. Известных носителей с такой фамилией в открытых источниках не зафиксировано, что только подчёркивает её локальный, почти деревенский характер.