Фамилия Прокубовский — одна из тех, где корень спрятан за привычным суффиксом, и разобрать её сходу непросто. Начнём с самого очевидного: окончание -ский указывает на типичную модель образования фамилий у польской, украинской и белорусской шляхты, а также у русского духовенства и мещанства. Но в данном случае перед нами, скорее всего, не географическая фамилия от названия населённого пункта (типа «из Прокубова»), а прозвищная, образованная от личного имени или профессионального прозвища.

Основа «Прокуб» — это и есть ключ. Самая вероятная версия: Прокуб — это вариант просторечной формы имени Прокопий (от греческого «прокопэ» — успех, преуспевание). В русских говорах имя Прокопий сокращали до Прокоп, Прокоша, а в польском и западнорусском диалекте — до Прокуб. Суффикс -овский в таком случае присоединяли к прозвищу Прокуб, которое давали либо по имени отца (Прокубов сын), либо по какой-то характерной черте человека, если прозвище закрепилось за ним самим. Менее убедительная, но возможная версия связывает «прокуб» с диалектным глаголом «кубить» — бить, колотить. Тогда «прокуб» мог означать «пробитый», «проломленный», и прозвище дали человеку с бойким или драчливым нравом. Однако эта версия слабее, так как глагол редок и не даёт устойчивой антропонимической модели.

Географически фамилия Прокубовский тяготеет к западным регионам бывшей Речи Посполитой — современной Беларуси, западной Украине и восточной Польше. Там суффикс -овский был особенно распространён среди мелкой шляхты, которая часто брала фамилии по имени предка-основателя. Поэтому носитель фамилии Прокубовский, скорее всего, потомок человека по прозвищу Прокуб, возможно, крестьянина или ремесленника, которого в документах записали по отцу или по его собственному имени в польской огласовке.

В отличие от фамилий на -ов, которые у русских крестьян часто были просто патронимическими, -ский придавал фамилии оттенок принадлежности к «благородному» сословию, хотя на деле мог принадлежать и зажиточному крестьянину, получившему фамилию при освобождении от крепостной зависимости. В любом случае, Прокубовский — это не случайное сочетание звуков, а живой след имени Прокопий, который через века и диалекты добрался до нас в такой форме.