Фамилия Прожуан — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Основная трудность в том, что она не вписывается в типичные модели русских фамилий на -ов, -ин или -ский. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная не от славянского корня, а от французского или румынского слова, попавшего в русскую среду через переселенцев или военную службу.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с французским глаголом projeter — «проектировать, задумывать, бросать вперёд». В таком случае основа могла быть переосмыслена на русской почве: от слова «прожект» (устаревшее «проект») с добавлением суффикса -ан, который в русских фамилиях встречается редко, но иногда указывает на принадлежность к чему-либо (ср. фамилии типа Полян, Роман). Таким образом, Прожуан могло означать «человек, связанный с проектами» — возможно, инженер, архитектор или прожектёр (в старом смысле — составитель планов).

Менее распространённая, но возможная гипотеза — связь с румынским словом projuan (от лат. proiectus), которое в некоторых диалектах могло обозначать «выходец, пришлый» или «человек из другого села». В этом случае фамилия указывала бы на географическое происхождение предка, а не на его занятие. Учитывая, что румыноязычное население исторически жило на юго-западе Российской империи (Бессарабия, Херсонщина), такой вариант не исключён, хотя лингвистически он слабее французского.

Словообразовательная модель фамилии необычна: окончание -ан, а не -ов, что говорит о её позднем оформлении или о том, что она не прошла стандартную русификацию. Если бы предка звали, скажем, Прокофий, фамилия звучала бы как Прокофьев. Здесь же основа «Прожу» не имеет аналогов в славянском именослове. Искать корни в русских говорах (например, от слова «прожуй» — «прожорливый») — натяжка, так как суффикс -ан в таком значении не типичен для прозвищ.

Географически фамилия Прожуан встречается крайне редко, в основном в записях XIX — начала XX века на юге России и в Причерноморье. Это косвенно подтверждает версию о французском или румынском следе: в Одессе и окрестностях жили французские колонисты, а также выходцы из Дунайских княжеств. Носители фамилии могли быть мелкими дворянами, отставными военными или городскими ремесленниками — точных данных о сословной принадлежности нет, но сам факт редкой нерусской основы говорит о нестандартном социальном пути предков.