Фамилия Прухницкая — женская форма фамилии Прухницкий, и её происхождение напрямую связано с географическим названием. В основе лежит топоним Прухница — так могло называться село, деревня или урочище. Модель образования типична для польской и западнорусской (особенно белорусской и украинской) ономастики: суффикс -ицк-/-ницк- указывает на принадлежность к месту. Носитель фамилии Прухницкий — это, скорее всего, выходец из Прухницы, то есть человек, чей род происходил из этого поселения.

Корень «прух-» — тёмный и заставляет задуматься. В славянских языках есть глагол «прухать» (пахнуть, издавать запах) или диалектное «прух» (труха, гниль, рыхлая земля). В польском языке «pruchno» означает трухлявое дерево, гниль. Поэтому Прухница могла быть деревней, основанной на болотистой, рыхлой почве или в лесу с гнилым валежником. Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит личное прозвище Прух — неопрятный или слабый человек, хотя топонимическая версия выглядит убедительнее.

Фамилия Прухницкая — довольно редкая. Встречается преимущественно в западных регионах бывшей Речи Посполитой: на территории современной Польши, в Западной Беларуси и на Украине. В России она могла появиться в результате миграций после разделов Польши в конце XVIII века или позже, в советское время. Сословно носители такой фамилии — скорее всего, мещане или шляхта (мелкопоместные дворяне), так как фамилии на -ский/-цкий в этой среде были особенно распространены.

Сравните с однокоренными фамилиями: Прух, Прухов, Прухин, Прухницкий. Более простые формы на -ов и -ин могли возникнуть в русской среде, тогда как Прухницкий сохранил польско-литовский отпечаток. Если ваши предки носили эту фамилию, ищите корни в метрических книгах католических или униатских приходов на западе бывшей Российской империи — там скорее всего найдётся и сама Прухница.