Фамилия Прушковський звучит как типичная польская или украинская фамилия с суффиксом -ський/-ский, который указывает на дворянское происхождение или связь с географическим объектом. Однако её основа — Прушк- — не даёт однозначного ответа. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от названия населённого пункта. Наиболее вероятный кандидат — Прушкув (Pruszków) в Польше, город или село, от названия которого через суффикс -ский/-ський и появился Прушковський. Такая модель типична для шляхетских фамилий: человек, владевший землёй или живший в Прушкуве, получал прозвание по месту.

Но есть и другая версия, менее очевидная, но более распространённая в восточнославянской среде. Основа Прушк- может восходить к прозвищу Прушок, которое в свою очередь связано с диалектным словом «прус» или «прушок» — так в некоторых говорах называли таракана, насекомое-вредителя. Прозвище Прушок могли дать человеку суетливому, юркому или, наоборот, надоедливому. В украинском языке есть слово «пруський» — относящийся к Пруссии, но для фамилии это менее вероятно, так как прилагательное «пруський» дало бы форму Пруський, а не Прушковський.

Суффикс -ов- в середине фамилии (Прушк-ов-ський) характерен для топонимических фамилий: он связывает основу с названием места (Прушково, Прушков). Таких сёл или хуторов с корнем Прушк- могло быть несколько на территории нынешней Польши, Беларуси и Украины. В польской ономастике фамилия Pruszkowski встречается и записана в исторических документах, что подтверждает её шляхетское происхождение. На украинских землях фамилия могла появиться через полонизацию или как результат переселения.

Таким образом, Прушковський — это фамилия с двойной этимологией: либо от названия места (скорее всего, Прушкув в Польше), либо от прозвища Прушок. Первая версия правдоподобнее из-за суффикса -ський, который в украинской и польской традиции почти всегда указывает на связь с местностью. Носители фамилии могли быть мелкими шляхтичами или крестьянами, получившими фамилию по месту жительства. Встречается она в основном в западных регионах Украины и в Польше, что подтверждает её географическую привязку.