Фамилия Пупялене звучит для русского уха непривычно, и это закономерно: она не русская, а литовская. Её выдает суффикс -ене, который в литовской ономастике однозначно указывает на женскую форму фамилии. В Литве, в отличие от России, фамилии жён и дочерей образуются от фамилии мужа или отца с помощью особых суффиксов. Пупялене — это фамилия замужней женщины, а её муж или отец носил бы фамилию Пупялис (Pupalis) или, реже, Пупяла (Pupala). Мужской вариант Пупялис образован с помощью типичного литовского суффикса -ис, обозначающего принадлежность к роду.

Теперь разберем корень. Основа «пуп-» (pup-) в литовском языке означает «боб». Слово pupa — это боб, бобовое растение. Соответственно, Пупялис — это нечто вроде «Бобовый» или «Бобов». Такие прозвища давали в Литве по нескольким причинам. Самая вероятная — человек занимался выращиванием или продажей бобов, либо его хозяйство славилось бобовыми полями. Второй вариант — прозвище по внешности: круглый, полный человек, напоминающий боб. Третий, более редкий — прозвище по характеру, возможно, «простой как боб» или «медлительный».

Особенность фамилии Пупялене в том, что она почти не встречается за пределами Литвы и не имеет русских аналогов. В России однокоренные фамилии (от слова «боб») — это Бобов, Бобков, Бобылёв. Но литовская модель образования фамилий (суффикс -ис для мужчин и -ене для женщин) делает Пупялене чужой для восточнославянской традиции. Если вы носите эту фамилию, ваши предки, скорее всего, были крестьянами или мелкими землевладельцами на территории современной Литвы, а сама фамилия закрепилась за родом не позднее XVII–XVIII веков, когда в Литве окончательно оформилась система наследственных фамилий.