Фамилия Пушторский почти наверняка указывает на географическое происхождение рода, а не на личное прозвище. В основе лежит название Пушторского озера в Вологодской области, которое также называют Пушт-Озером. Это крупный водоём в холмистой местности; окрестности именуются Пуштора, а вытекающая река — Пушторка. Такой пучок названий — озеро, река, местность — типичен для мест, где фамилия закрепилась за целой округой.

Сам гидроним, скорее всего, финно-угорского происхождения, что логично для русского Севера. Исследователи выводят его из вепсского языка: либо от «pustolan» (пустошь, залежь), либо от «poht» (небольшой залив реки или озера). Обе версии правдоподобны, и обе описывают природные особенности места: либо заброшенные земли, либо изрезанную береговую линию. Вепсы издавна жили на этих территориях, и их топонимы легко переходили в русскую речь, а затем и в фамилии.

Суффикс -ский в фамилии — классический признак «географической» фамилии. Так обычно называли тех, кто происходил из конкретного места или владел землёй рядом с ним. В отличие от крестьянских фамилий на -ов и -ин, которые часто образовывались от личных имён и прозвищ, фамилии на -ский чаще носили дворяне, духовенство или выходцы из городов. Поэтому Пушторский — это, вероятно, потомок человека, который либо родился у Пушторского озера, либо получил земельный надел в тех краях и стал именоваться по владению.

Существует и альтернативная гипотеза, выводящая фамилию от украинского слова «пушта» — так называют безлесные венгерские степи. По этой версии, прозвище Пуштор давали человеку, жившему в степи, вдали от леса. Однако эта версия выглядит слабее: слишком далеко от Вологодчины и слишком мало следов украинского влияния в северных русских фамилиях. Гораздо логичнее предположить, что перед нами местный, северный след, а не южный степной.

Если принять основную версию, то родоначальник фамилии жил в Вологодской губернии, возможно, на берегу озера или в деревне, которая позже вошла в состав округи Пуштора. Такие фамилии нередко возникали у крестьян, переселявшихся в другие волости: им нужно было объяснять, откуда они пришли, и они называли себя по родному озеру или реке. Пушторский — редкая фамилия, и её носители, скорее всего, до сих пор имеют корни в тех местах, хотя со временем разъехались по стране.