Фамилия Пысиков — одна из тех, что образована от прозвища, и её основа лежит не в книжном, а в живом, разговорном языке. В её центре — слово «пысик», которое в русских говорах имеет несколько значений. Самое распространённое — маленькая собачка, мопс, или вообще любая небольшая, курносая собака. В некоторых диалектах «пысиком» называли также человека с приплюснутым, курносым носом, то есть прозвище могло быть дано по характерной внешней черте. Встречается и более редкое значение — «увалень», «неповоротливый человек», что тоже могло стать основой для прозвища.

Суффикс -ов указывает на типичную модель образования русских фамилий: Пысик — Пысиков, то есть «сын Пысика» или «из семьи Пысика». Фамилия эта довольно редкая и сконцентрирована в центральных и северных регионах России. Встречается она, например, в старых переписях Вологодской и Архангельской губерний, что косвенно подтверждает её связь с северными говорами, где слово «пысик» было особенно употребительно.

Интересно, что у фамилии есть близкий «родственник» — фамилия Пысин, образованная по той же основе, но с другим суффиксом (-ин). Если Пысиков происходит от прозвища Пысик, то Пысин — напрямую от слова «пыса» (собачья морда, рыло), что ещё раз подчёркивает «собачью» или «носатую» тематику исходных прозвищ. Таким образом, предок носителя фамилии Пысиков, скорее всего, получил своё прозвище либо за внешнее сходство с небольшой курносой собакой, либо за характерный нос, либо — что реже — за медлительность и неповоротливость.