Фамилия Рачишен — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных для русских фамилий суффиксов -ов, -ев или -ин, что сразу наводит на мысль: перед нами не исконно великорусская модель, а скорее результат адаптации иноязычной основы.

Ключ к разгадке — окончание -ен. В русской ономастике фамилии на -ен часто встречаются среди потомков выходцев из Западной Украины, Белоруссии и Польши, где распространён суффикс -енко, усечённый до -ен. Однако в данном случае возможна и другая версия: фамилия могла возникнуть от прозвища или имени с корнем «рач-». В южнорусских и украинских говорах «рач» — это не только рак (животное), но и диалектное название человека с характерной походкой (вразвалку) или сварливого, «цепляющегося» человека. Тогда Рачишен — это чей-то сын или подмастерье: буквально «Рачишин» или «Рачишенко», где суффикс -ен указывает на принадлежность.

Есть и более экзотическая гипотеза. Фамилия может быть связана с географическим названием, например, с местечком Рачицы или Рачишин (подобные топонимы встречаются в Белоруссии и на Волыни). В этом случае Рачишен — это «тот, кто родом из Рачишина», то есть типичная «географическая» фамилия, образованная по модели, характерной для западных славянских земель.

Окончательно установить точный корень сложно из-за редкости фамилии. В дореволюционных справочниках она практически не встречается, что говорит о её позднем закреплении или малочисленности рода. С уверенностью можно сказать лишь одно: Рачишен — фамилия не московской, а западнорусской или польско-украинской традиции, и предки носителя, скорее всего, жили на территории современной Западной Украины, Белоруссии или восточной Польши.