Фамилия Раиса — редкий случай, когда в основе лежит женское имя, причём не крестильное в его народной форме, а книжное, почти литературное. Исходное имя Раиса греческого происхождения (Ῥαΐς, от ῥᾴδιος — «лёгкая», «податливая»), и в русский обиход оно вошло через святцы, но массового распространения среди крестьян не получило. Поэтому фамилия, образованная от него напрямую, без усечения или суффикса, — явление нечастое.

Здесь работает простейшая модель: имя Раиса без изменений стало фамилией. Обычно так закреплялись прозвища или имена в среде, где фамилии только начинали складываться и паспортная запись фиксировала человека по имени матери или жены, если та была главой дома. Скорее всего, предок носителя фамилии был сыном или мужем женщины по имени Раиса, и в документах его записали по ней — «Раиса» в значении «Раисин сын» или «Раисин муж». Полная, нередуцированная форма имени говорит о том, что это произошло не в глухой деревне, а скорее в городской или мещанской среде, где имя употребляли без уменьшительных вариантов вроде Раиска или Рая.

В отличие от фамилий на -ин (Раисин, Раискин), которые образуются от тех же основ стандартно, «чистая» Раиса стоит в ряду так называемых неизменяемых фамилий. Они характерны для южных и западных регионов бывшей Российской империи — Украины, Беларуси, Молдавии, а также для казачьих областей. Там фиксация имени в родительном падеже или с суффиксом была необязательна, и фамилию могли записать в именительном падеже без морфологических изменений. Встречается она и у потомков духовенства, где иногда давали фамилии по именам святых, но имя Раиса в святцах есть, хоть и не самое ходовое.

Других версий, связывающих фамилию с арабским корнем (раис — «глава», «предводитель»), выдвигать не стоит: это омонимия, возникшая случайно. В русской традиции фамилия Раиса однозначно восходит к женскому личному имени, и попытки найти в ней восточный след — натяжка, не подтверждённая историей бытования фамилии в русских говорах.