Фамилия Рефиханова — явный случай, где географическое происхождение важнее, чем разбор корня. Она сразу выдаёт носителя, чьи предки жили или до сих пор живут в регионах традиционного ислама на территории бывшего СССР: в Татарстане, Башкортостане, среди кавказских народов (особенно дагестанских) или в среде среднеазиатских тюрков. Женская форма на -а указывает на то, что перед нами вариант от мужской фамилии Рефиханов, которая образована по русской модели притяжательного прилагательного с суффиксом -ов.

Основа фамилии — составное арабское имя Рефихан (варианты: Рифхан, Рифатхан). Первая часть «Рефи» (от арабского «рафи’») означает «высокий», «возвышенный», «почтенный». Вторая часть «хан» — тюркский титул, который в составе личных имён часто не имел прямого значения «правитель», а служил уважительным компонентом, подчёркивающим благородство или просто пожелание величия. Таким образом, имя Рефихан можно перевести как «почтенный господин» или «возвышенный правитель».

С точки зрения словообразования, фамилия Рефиханова стоит в ряду с десятками других фамилий на -ханов, которые массово возникали в XIX—XX веках у татар, башкир и народов Кавказа. В отличие от русских фамилий на -ов, которые часто происходят от прозвищ или профессий, здесь основа — личное имя, которое давали в честь религиозных или светских авторитетов. Это типичная фамилия для мусульманского духовенства или торговых семей, где ценилась грамотность и уважение к традиции.

Спорных версий здесь немного. Иногда первую часть путают с именем Рафик («друг», «товарищ»), но «Рефи» в данном случае — это именно арабский корень со значением высоты, а не дружбы. Встречается также написание «Рифханова» — это диалектное или транскрипционное колебание, сути не меняющее. В целом, фамилия Рефиханова — это точный маркер того, что предки носительницы были людьми с положением в своей общине, носителями имени, которое давали не каждому.