Фамилия Рефяк — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не типичная великорусская фамилия, а скорее всего, адаптированная форма из другого языка. Скорее всего, основа — личное имя или прозвище, а окончание -як типично для западнославянских, украинских, белорусских и отчасти польских фамилий (ср. Бойко, Грицак, Пинчук, Лисняк). Суффикс -як часто обозначал принадлежность к чему-либо или характерный признак: «сын такого-то» или «человек из…».

Корень «Реф-» встречается крайне редко. Самая вероятная версия — искажённое или диалектное произношение имени Рафаил (в просторечии Раф, Рафик, Рефа). В народной среде имя Рафаил нередко сокращалось до Рефа, а далее по модели «Рефа + як» образовалась фамилия со значением «потомок или человек по имени Рефа». Подобные случаи известны: от имени Афанасий пошли фамилии Афоня, Афоняк, Афонин. Если это так, то предки носителя фамилии Рефяк могли быть крещёными людьми, получившими библейское имя (Рафаил означает «Бог исцелил»), и фамилия закрепилась в среде, где суффикс -як был продуктивным — на западе или юго-западе Российской империи.

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слово «реф» (или «раф») в значении «ряд», «порядок», а также личное имя Реф, но такое объяснение слабее: тюркские фамилии в русском контексте обычно оформлялись через -ов/-ев, а не через -як. Скорее всего, перед нами именно восточнославянская фамилия, возникшая в среде украинского или белорусского крестьянства или мещанства.

Географически фамилия Рефяк встречается единично, в основном на территории Украины и в южных областях России. В дореволюционных переписях она не фиксируется массово, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от единственного рода в одном селе. Сословно предки могли быть крестьянами или казаками, так как именно в этих группах активно использовались прозвищные и патронимические фамилии на -як без дворянского оформления.

Таким образом, фамилия Рефяк — это, скорее всего, патроним от имени Рефа (Рафаил), образованный по западнорусской модели, с характерным суффиксом, указывающим на происхождение из простонародной среды. Точных данных о дворянских корнях или массовом распространении нет, что делает фамилию уникальной по своему происхождению.