Фамилия Рнепйцукеджхюяя — настолько редкая и необычная для русского языка, что её появление можно объяснить только случайностью или поздним заимствованием. В ней нет ни одного славянского суффикса (-ов, -ин, -ский), ни привычной корневой основы. Скорее всего, перед нами не исконная русская фамилия, а либо искусственное образование (например, при смене документов или в результате ошибки писаря), либо транслитерация иноязычной фамилии, записанной кириллицей по принципу «как слышу, так и пишу».

Если попытаться разобрать её по модели, то длинная цепочка согласных «рнпйцкджхю» характерна для языков Кавказа, Прибалтики или тюркской группы. Например, фамилии с обилием взрывных и шипящих звуков встречаются у грузин (Рцхиладзе), армян (Мкртчян) или в балтийских языках. Однако окончание «-яя» в русском языке обычно указывает на прилагательное (как у фамилий Толстая, Белая), но здесь оно присоединено к неразложимому консонантному блоку, что нетипично.

Вероятнее всего, фамилия Рнепйцукеджхюяя — результат ошибки при паспортизации XX века, когда сложную иноязычную фамилию записали «на слух» с искажениями, а затем закрепили в документах. Её носители могли быть выходцами из Закавказья или Средней Азии, получившими паспорта в советское время. Разобрать фамилию на корень и суффикс без знания исходного языка невозможно, поэтому единственное, что можно сказать с уверенностью: её уникальность — в полном отсутствии славянских словообразовательных элементов, что делает её редчайшим исключением в русском ономастиконе.