Фамилия Рогункова — женская форма фамилии Рогунков, и её разговорный вариант (на -а) указывает, что в быту, в деревне или в документах женщину называли по мужу или отцу. Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный русский суффикс -ов- и окончание -а. Остаётся основа «Рогунк-», которая восходит к прозвищу или неканоническому имени Рогун, Рогунок.

Самая прямая версия — от слова «рог». В русских говорах «рогуном» могли называть упрямого, бодливого человека (как бык), либо того, кто торгует рогами или делает из них гребни и пуговицы. Но есть и менее очевидный вариант: в некоторых диалектах «рогун» — это вид растения (например, рогоз), и прозвище мог получить человек, живший у заросшего пруда или занимавшийся плетением из рогоза. Третья, более редкая версия — от имени Рогволод (скандинавское Ragnvaldr) через народное сокращение «Рогун», но это спорно: имя Рогволод бытовало в древнерусской знати, а фамилия Рогунков — простонародная, крестьянская.

Фамилия довольно редкая. Её география — в основном центральные и северные области России (Вологодская, Архангельская, Костромская), где сохранились архаичные прозвища. Суффикс -ов- указывает на типичную модель «чей?» — то есть Рогунков буквально «сын Рогуна». Так что предок носительницы фамилии, скорее всего, был крестьянином или ремесленником, которого в деревне знали по характерной черте — упрямству, работе с рогом или месту жительства.