Фамилия Рогущенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках была распространена на Левобережной и Слободской Украине, а затем закрепилась в южнорусских регионах. Суффикс -енко в украинской ономастике традиционно означал «сын» или «потомок»: Рогущенко — буквально «сын Рогуща» или «маленький Рогущ».

Основа фамилии — Рогущ — вызывает вопросы. Самая вероятная версия: это диалектное или разговорное производное от прозвища Рог. В украинских говорах «ріг» могло означать не только часть тела животного, но и угол, мыс, выступ местности. Человек по прозвищу Рог мог жить на изгибе реки, на краю села или иметь упрямый, «рогатый» характер. От Рог образовали уменьшительную форму Рогущ (как, например, от «кот» — «котущ»), а от неё — фамилию с патронимическим суффиксом.

Менее вероятна, но возможна связь с редким личным именем Рогущ — его могли давать в качестве охранительного имени, чтобы уберечь ребёнка от сглаза, или как производное от канонического Родион (в просторечии Родька, Рогуня). В пользу украинского происхождения говорит и характерный суффикс -енко: в России фамилии на -енко встречаются реже и обычно указывают на миграцию с юго-запада.

Географически Рогущенко чаще всего фиксируют в Черниговской, Полтавской и Харьковской областях, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Ставрополье. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла писаться через «о» (Рогущенко) или через «а» (Рагущенко) — это отражало акающее произношение в южных говорах.

Однокоренные фамилии — Рогушин, Рогунов, Рогульский. Но Рогущенко стоит особняком: если Рогуновы могли происходить от прозвища Рогун (крикун, задира), то Рогущенко — более поздняя форма, подчёркивающая родственную связь через суффикс -енко. Сословного барьера у фамилии не было: её могли носить и казаки, и крестьяне, и мещане.