Фамилия Рудобаба — редкий пример того, как в основе лежит не имя, не профессия, а ёмкое прозвище, составленное из двух корней. Первая часть — «рудо-» (от слова «руда» в значении «кровь»), вторая — «баба» (женщина). Прямое значение прозвища — «кровавая баба». В народной речи так могли назвать женщину с ярким, румяным лицом, либо же ту, что отличалась крутым нравом, «кровь с молоком» — но с оттенком грубоватой, даже пугающей силы. В некоторых говорах «рудой» означало «рыжий», поэтому нельзя исключать, что прозвище относилось к рыжеволосой женщине.

Словообразовательная модель проста: к основе прозвища «Рудобаба» прибавили нулевой суффикс, и фамилия застыла в форме именительного падежа, без типичных окончаний -ов, -ин или -ский. Такие «чистые» фамилии в русской традиции встречаются реже, чем патронимические, и обычно указывают на то, что прозвище было настолько устойчивым, что стало фамилией без изменений. Сравните с похожими по структуре: Голопуз, Кривошея, Вертихвост.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям, где слово «руда» в значении «кровь» было особенно распространено. В украинском языке «руда» — это и «руда» (полезное ископаемое), и «кровь» (в диалектах), а «баба» — обычное обозначение женщины. Встречается фамилия и в Беларуси. В современных справочниках (например, в работах Ю.К. Редько по украинским фамилиям) Рудобаба упоминается как характерный пример прозвищной фамилии, образованной от внешней или поведенческой черты.

Споров о происхождении немного: версия с «кровавой бабой» — основная и наиболее логичная. Менее вероятно, что в основе лежит ремесло (рудокоп или работник с рудой), так как вторая часть «баба» в таком контексте необъяснима. Если предок был рудокопом, его назвали бы Рудокопов или Рудников, а не Рудобаба. Так что носитель фамилии с большой вероятностью получил её от предка-женщины, которую в округе прозвали за яркую внешность или резкий характер.