Фамилия Рудофилов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а сложное прилагательное, образованное от слияния двух корней. Разбираем её по составу: «Рудо-» и «-фил». Первая часть восходит к слову «руда» (в древнерусском — кровь, а также металл, ископаемое), вторая — к греческому «филос» (любовь, любитель). Таким образом, прозвище Рудофил в буквальном смысле означало «любящий руду» или «любящий кровь». В русской ономастике это искусственное образование, характерное для семинарской среды XVIII–XIX веков.

Фамилия принадлежит к самому распространённому типу русских фамилий — на «-ов». Суффикс указывает на принадлежность: Рудофилов — сын или потомок Рудофила. Такие фамилии массово давали в духовных училищах и семинариях, где будущим священникам нередко меняли фамилии на «говорящие» — благозвучные или назидательные. Рудофилов — типичный пример «семинарской» фамилии, построенной по модели греко-русской кальки. Сравните с однокоренными, но более прозрачными: Рудолюбов (тот же смысл, но на славянский лад) или Христофилов (любящий Христа).

Версия о происхождении от реального прозвища Рудофил, данного за любовь к горному делу или добыче руды, выглядит менее вероятной. Для профессиональных прозвищ в русском языке использовали более простые формы (Рудокопов, Рудников, Рудометов — от «руду метать», то есть пускать кровь). Греческий корень «-фил» в народной среде нехарактерен, поэтому основная гипотеза — искусственное книжное образование.

География фамилии подтверждает её семинарское происхождение. Рудофиловы встречаются в центральных губерниях России, особенно в бывших Рязанской и Тамбовской губерниях, где было много духовных учебных заведений. Встречается фамилия и у казаков, но там она, скорее всего, вторична — могла попасть вместе с переселёнными священниками или быть дана при записи в реестр по созвучию.

Таким образом, если ваши предки — Рудофиловы, с высокой вероятностью они происходят из духовного сословия. Фамилия — не бытовое прозвище, а «учёное» переосмысление, которое давали в семинарии, чтобы отличить одного Ивана от другого. Исходное значение — «любитель руды» (металла) или, в библейском контексте, «любитель крови» (как символ страдания), но в быту закрепилось первое, более благозвучное толкование.