Фамилия Руджюнас — характерный пример литовской модели образования фамилий, которая заметно отличается от русской или польской. Её основа — литовское слово rudis, которое имеет два основных значения: «рыжий» (о цвете волос или масти животного) и «гнедой» (о лошади). Таким образом, прозвище Руджюс (Rudžius) давали либо рыжеволосому человеку, либо тому, кто имел дело с гнедыми конями — например, конюху или владельцу такой лошади.

Суффикс -юнас (-iūnas) в литовских фамилиях выполняет роль патронимического показателя, то есть указывает на происхождение: Руджюнас буквально означает «сын Руджюса» или «потомок Руджюса». Это одна из самых распространённых моделей образования фамилий в Литве, наряду с суффиксом -ивичюс/-явичюс. Встречаются и варианты, записанные по-польски или по-русски: Рудзевич, Руджявичюс — но Руджюнас сохраняет именно литовский суффикс.

Географически фамилия тяготеет к восточной и южной Литве, особенно к районам Вильнюса, Шальчининкай, Эйшишкес, где исторически было сильное смешение литовского, польского и белорусского населения. После присоединения Литвы к Российской империи фамилию могли записать в метриках как Руджюнас, Рудженос или даже Рудзюнас — единого стандарта не было. В советское время написание закрепилось, и сегодня это довольно редкая, но узнаваемая литовская фамилия.

Интересно, что в отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые часто утратили связь с исходным прозвищем, Руджюнас сохраняет прозрачную этимологию: любой литовец сразу поймёт, что предок был рыжим или держал гнедых лошадей. Никакого иного, более древнего или тайного значения у фамилии нет — это простая, но точная характеристика человека, данная ему окружающими несколько веков назад.