Фамилия Рухер — редкая в русском контексте, и её происхождение напрямую связано с историей немецких колонистов в России. Вопреки возможному предположению о славянских корнях, фамилия имеет немецкую основу и встречается преимущественно среди потомков поволжских немцев.

В основе фамилии лежит немецкое слово «Rucher» или диалектное «Rücher». Наиболее вероятное значение восходит к средневерхненемецкому «ruoch» — «забота, попечение». Соответственно, «Rucher» могло означать «заботливый, рачительный хозяин» или же указывать на профессию: человека, который занимался надзором, присмотром за чем-либо. Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с топонимом Рухер (Rucher) — названием нескольких небольших поселений в Германии, откуда предки носителя фамилии могли быть родом.

Фамилия попала в Российскую империю в XVIII–XIX веках, когда по манифестам Екатерины II и Александра I в Поволжье переселялись немецкие крестьяне и ремесленники. В метрических книгах лютеранских приходов Саратовской и Самарской губерний фамилия Рухер фиксируется с середины XIX века. Суффикс -ер (нем. -er) в данном случае — типичный для немецких фамилий, образованных от глаголов или существительных, указывающий на деятеля.

Стоит отметить, что в современной русской среде фамилия не склоняется по падежам, если принадлежит мужчине (Иван Рухер), и склоняется, если принадлежит женщине (Анны Рухер), что типично для заимствованных фамилий. Встречаются также варианты написания — Рухер, Рухэр, но основная форма закрепилась именно с «е». Таким образом, предки носителя фамилии Рухер, скорее всего, были немецкими колонистами, занимавшимися земледелием или ремеслом, и фамилия подчёркивала их хозяйственную добросовестность.