Фамилия Рухкян — яркий пример армянской модели образования фамилий, и её разбор стоит начать именно с суффикса. Конечное -ян (в старой орфографии -янц) — самый распространённый патронимический суффикс в армянском языке. Он означает «принадлежащий к роду такого-то» или «потомок такого-то». В русской записи фамилий из Закавказья он часто сохраняется без изменений, хотя в самой Армении после реформы орфографии его могли писать как -յան. Таким образом, Рухкян — это «из рода Рухка» или «сын Рухка».

Основа фамилии — Рухк — почти наверняка представляет собой вариант армянского имени или прозвища. Наиболее вероятная версия связывает её с армянским словом «рух» (ռուխ), которое в диалектах означает «дух», «дыхание» или «сила». В таком случае Рухк могло быть прозвищем энергичного, живого человека, либо, что реже, именем-оберегом, связанным с духовным началом. Менее популярная, но допустимая гипотеза — связь с тюркским корнем «рух» (в значении «лицо», «щёки»), проникшим в армянские говоры через многовековое соседство. Тогда прозвище могло относиться к человеку с румяным или широким лицом.

География фамилии Рухкян довольно показательна. Подавляющее большинство носителей встречается в Армении и в армянских диаспорах России (особенно в Краснодарском крае, Ростовской области и Москве), а также в Грузии (регион Самцхе-Джавахети). Внутри самой Армении фамилия не относится к числу массовых, что указывает на её локальное происхождение — вероятно, из одного или нескольких соседних сёл. Исторически такие фамилии часто возникали в среде ремесленников или крестьян, но без дополнительных генеалогических изысканий точнее сказать о сословной принадлежности предков-Рухкян сложно.

Интересная деталь: в русском языке фамилию иногда путают с похожей по звучанию фамилией Рухля (или Рухлин), но это совершенно разные корни. Рухля — русское прозвище от «рухлядь» (имущество, скарб), а Рухкян — армянский патроним, не имеющий к этому никакого отношения. В написании фамилии также встречается вариант Рухкянц — с сохранением древнего окончания родительного падежа множественного числа, что характерно для фамилий армян, эмигрировавших в XIX веке в страны Ближнего Востока или Европы.