Фамилия Рухшона — редкая и нестандартная для русского быта. Чтобы понять её природу, достаточно посмотреть на окончание: -а. В русской фамильной системе на -а обычно оканчиваются фамилии украинского, белорусского или польского происхождения (Шевченко, Ковальчук, Сковорода) либо женские формы мужских фамилий. Но здесь случай иной.

Основа «Рухшон» не имеет славянских корней. Она восходит к таджикскому или персидскому имени Рухшона (Рухшана, Рухшон). На фарси слово «рухшон» (рухшан) означает «сияющая», «лучезарная», «светлая». Это женское имя, популярное в Иране, Таджикистане, Афганистане и среди народов Средней Азии. Встречается и в тюркских языках, куда попало из персидского.

Таким образом, фамилия Рухшона — это по сути нефамильная форма. Скорее всего, перед нами не устоявшаяся наследственная фамилия в русском понимании, а патроним или просто имя, записанное как фамилия в документах. Так бывало при советских паспортизациях в Средней Азии: человека по имени Рухшона (дочь Рухшоны) записывали в графу «фамилия» именно так, без переделки в Рухшонов или Рухшонин.

Вероятнее всего, носитель этой фамилии — выходец из Таджикистана или Узбекистана, где женские имена на -а часто становились официальными фамилиями без изменения. Если же фамилия встречается у этнических русских — это единичный случай, связанный с браком или усыновлением, либо с записью по метрике матери.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна тем, что сохранила исходное имя в чистом виде, без суффиксов принадлежности. Это редкий пример, когда фамилия не говорит о роде занятий или прозвище предка, а прямо указывает на имя прародительницы — «сияющей».