Фамилия Руйсс в её написании Ruiss оставляет впечатление западноевропейской, но при ближайшем рассмотрении распадается на две непохожие версии происхождения, и какая из них верна для конкретной семьи — зависит от того, где жили предки.

Первая версия выводит прозвище Ruiss из французского нарицательного ruisseau — «ручей, поток, канава». В этом случае фамилия указывает на место жительства: предок поселился у водоёма, у ручья или у сточной канавы, и соседи закрепили за ним это прозвище. Во французской ономастике такие фамилии-топонимы встречаются часто, и написание Ruiss выглядит как сокращённый или искажённый при переносе в другую языковую среду вариант от ruisseau. Если семья происходила из франкоязычных регионов — Франции, Валлонии или франкоязычной Швейцарии, — эта версия наиболее правдоподобна.

Вторая версия отводит фамилию к испанскому ruis, что означает «последний ребёнок в семье». Такое прозвище могли дать младшему сыну, и оно закрепилось за ним как фамилия. Но здесь есть слабое место: в испанском языке слово ruis в значении «последний ребёнок» не является общеупотребительным и скорее относится к диалектной или устаревшей лексике. Кроме того, написание Ruiss с удвоенной s нехарактерно для испанской орфографии, где чаще встречается Ruiz — патронимическая фамилия от имени Ruy. Поэтому испанская версия возможна, но уступает французской в убедительности.

Дополнительную путаницу вносит то, что фамилия Руйсс в русском написании может быть и германизированной формой: в немецком и нидерландском языках сочетание ui передаёт звук, близкий к русскому «ау», и фамилия Ruiss могла возникнуть как вариант фамилии Ruijs или Ruis, восходящей к тем же французским корням. В Нидерландах фамилия Ruis действительно встречается и нередко имеет именно французское происхождение, связанное с гугенотами, переселившимися в Голландию после отмены Нантского эдикта в 1685 году.

Словообразовательная модель проста: фамилия образована от прозвища без дополнительных суффиксов, что типично для западноевропейских фамилий, которые часто закрепляли прозвище в чистом виде. В русской традиции такая фамилия не склоняется по падежам, если принадлежит мужчине, и не изменяется вовсе, если принадлежит женщине.

Документальных свидетельств о распространении фамилии Руйсс в России немного, и это скорее редкая фамилия, чем массовая. Если ваши предки носили её в Российской империи, стоит искать следы среди обрусевших иностранцев — французов, голландцев или немцев, которые могли приехать по приглашению на службу или в качестве мастеровых. В таком случае более вероятной остаётся французская версия с «ручьём», поскольку она объясняет и написание, и географию бытования.