Фамилия Рыпта — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она имеет искусственное, семинарское происхождение или же является результатом транслитерации иноязычной фамилии. В русской ономастике фамилии на -а, не имеющие суффиксов принадлежности (-ов, -ин), часто указывают на украинские, белорусские или польские корни, либо на происхождение из духовного сословия.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с латинским словом rupta — «разорванная, сломанная». В семинарской среде было принято давать будущим священникам «говорящие» фамилии, образованные от латинских или греческих понятий. Рыпта могла быть калькой с греческого ῥήγνυμι (рэгнюми — «ломать, разрывать») или напрямую заимствованием из латыни. В таком случае прозвище могло относиться к характеру человека — резкому, «ломающему» устои, либо к его физической силе.

Второй вариант — фамилия могла возникнуть как фонетическая запись фамилии от названия реки или местности. Например, в Прибалтике и на северо-западе России встречаются топонимы с корнем «рып» (ср. фин. ryppy — «морщина, складка» или карельское rypytä — «морщиться»). Если предки жили на берегу извилистой речки или в холмистой местности, их могли прозвать Рыпта — «тот, кто с морщинистого места». Однако эта версия менее надёжна, так как подобные прозвища обычно давались по конкретному объекту, а не по абстрактному признаку.

Интересно, что фамилия Рыпта не имеет однокоренных «родственников» в русском языке. Нет фамилий Рыптов, Рыптин, Рыптев, что подтверждает её изолированность. Это не крестьянская фамилия, образованная от имени или ремесла — в таком случае она бы обросла вариантами. Скорее всего, носители фамилии — потомки одного человека, получившего её искусственно, возможно, при поступлении в духовное училище. Сословно это могли быть выходцы из духовенства, реже — из обрусевших немцев или поляков, чья фамилия была адаптирована на русский лад.

Сегодня фамилия встречается единично, в основном на юге России и в Сибири, куда в XIX веке ссылали неблагонадёжных семинаристов. Точных сведений о знаменитых носителях нет — фамилия остаётся одной из тех загадок, где за коротким звучанием скрывается либо латинская учёность, либо исчезнувший топоним.