Фамилия Рюганова — женская форма фамилии Рюганов, и её происхождение стоит искать в прозвище или мирском имени предка. Основа фамилии — «Рюган», что, скорее всего, связано с глаголом «рюгать» (или «рюхать»), который в русских говорах означал «кричать, реветь, издавать громкие звуки». Такое прозвище мог получить человек с громким голосом, крикливый или, наоборот, тот, кто работал с шумными животными — например, пастух или погонщик скота.

Суффикс -ов- указывает на типичную модель русских фамилий, образованных от личного прозвища отца: «чей?» — Рюганов, то есть сын Рюгана. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «рюга» — так в некоторых областях называли грубую ткань или мешковину. Тогда Рюганом могли прозвать того, кто шил мешки или торговал холстом.

Фамилия редкая, и в дореволюционных переписях она почти не встречается. По данным современных справочников, Рюгановы чаще всего фиксируются в Поволжье и на Урале — в зоне позднего заселения, где фамилии часто закреплялись за крестьянами и мастеровыми людьми в XIX веке. География подсказывает, что предки могли быть государственными крестьянами или работниками заводов.

Однокоренные фамилии — Рюгин, Рюхов, Рюхин — встречаются чаще, и все они восходят к тем же звукоподражательным корням. В отличие от них, Рюганов сохранил более архаичную суффиксальную форму, что делает фамилию ценной для тех, кто изучает местные говоры и народную ономастику.