Фамилия Сабдыкеева образована от мужского имени Сабдыкей (вариант — Сабдыке). Это имя, скорее всего, тюркского происхождения, сложное по составу. Первая часть «саб» восходит к корню со значением «чистый, непорочный» или «утро». Вторая часть «дыкей» или «дыке» — вероятно, переосмысленный компонент, восходящий к слову «дике» (как, подобно) или к апеллятиву «дик» (прямой, ровный). Таким образом, имя могло означать «чистый, как утро» или «подобный чистоте». В тюркской ономастике такие двухосновные имена не редкость, они часто несли пожелание или характеристику.

Фамилия образована по русской модели: к основе имени Сабдыкей добавили суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного), а затем женское окончание -а. В русской традиции фамилии на -ев/-ов фиксировали принадлежность: Сабдыкеев — сын Сабдыкея, Сабдыкеева — дочь или жена Сабдыкеева. Такая модель была типична для всех сословий, но особенно широко распространилась в XIX веке при массовой паспортизации населения.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически расселялись тюркские народы: Татарстан, Башкортостан, Казахстан, а также киргизские и узбекские территории. Встречается она и у сибирских татар. В русских источниках фамилия фиксируется с конца XIX века, преимущественно в метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний. Написание с двойным «е» в конце (Сабдыкеева) — это стандартное оформление женского варианта, а мужской вариант — Сабдыкеев.

Стоит отметить, что в некоторых тюркских языках существует близкое имя Сабдыка (с ударением на последний слог), которое могло дать ту же фамилию, но с другим суффиксом. Однако форма Сабдыкеев указывает именно на исходное имя с конечным -ей, что более характерно для казахской и киргизской антропонимии. Социально предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, так как фамилии на -ев/-ов у тюркских народов часто закреплялись за податными сословиями, а не за аристократией.