Фамилия Сагутонов — редкий случай, когда при всей прозрачности суффикса основа вызывает вопросы и не позволяет дать единственный ответ. Суффикс -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: «чей?» — Сагутонов, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Сагутон. Но что скрывается за этим Сагутоном?

Самый вероятный путь — тюркское или монгольское происхождение основы. В тюркских языках есть корень «сагут» или «сагыт», означающий «подарок», «дар», а также «оружие» (например, саадак — колчан для стрел). Прозвище Сагутон могли дать человеку щедрому, либо, напротив, связанному с военным делом — оружейнику или лучнику. Учитывая, что фамилии на -ов у тюркских народов (татар, башкир, ногайцев) часто русифицировались при переходе в православие или при переписях, предок Сагутоновых вполне мог быть выходцем из тюркской среды, получившим фамилию по отцу-Сагутону.

Менее распространённая, но допустимая версия — от диалектного русского слова «сагута» или «сагутка». В некоторых говорах так называли болотистое, топкое место, мочажину. В этом случае прозвище Сагутон могло закрепиться за человеком, жившим у такого болота, или за неуклюжим, вязнущим в грязи человеком. Однако эта версия слабее — слово редкое и плохо зафиксировано в письменных источниках.

Географически фамилия Сагутонов встречается спорадически, без ярко выраженного гнезда. Единичные записи есть в Поволжье, на Урале и в Сибири — как раз в зонах активных контактов русского и тюркского населения. В дореволюционных метрических книгах фамилия почти не попадается, что говорит о её позднем оформлении (вероятно, вторая половина XIX века) или о малочисленности рода.

Словообразовательная модель проста: основа Сагут- + суффикс -он (уменьшительно-ласкательный или прозвищный формант, как в Иваш-он, Фед-юн) + -ов. То есть Сагутон — это не полное имя, а скорее домашнее, обиходное прозвище, которое затем стало фамилией отца. Сравните с фамилиями Сагута, Сагуткин — они явно однокоренные и указывают на ту же основу.