Фамилия Саховарова — женская форма фамилии Саховаров, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Модель образования здесь нестандартная: в основе лежит не типичное для русских фамилий окончание «-ов», а более редкое «-оваров». Этот суффикс указывает на профессию или ремесло, связанное с изготовлением или продажей чего-либо. В русском языке такие фамилии образовывались от названий товаров: «сахар» + «-овар» (от глагола «варить»). То есть Саховаров — человек, который варит сахар, то есть сахаровар.

Корень «сах-» восходит к слову «сахар», которое в русский язык пришло через греческое «σάκχαρις» из санскрита. В старину сахар был дорогим продуктом, и сахароварство — привилегированным ремеслом. Скорее всего, предок носителя фамилии работал на сахарном заводе или занимался частным производством сахара. Версия, что фамилия произошла от прозвища «Сахар» (сладкий, приторный человек), менее правдоподобна — суффикс «-овар» слишком конкретен и указывает именно на занятие.

Географически фамилия Саховаров (и её женская форма) редкая. Она встречается в центральных и южных регионах России, где в XVIII–XIX веках активно развивалась сахарная промышленность — в Тамбовской, Курской, Воронежской губерниях. Это косвенно подтверждает ремесленное происхождение, а не прозвищное. В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) подобные фамилии на «-оваров» не выделены в отдельную группу, но механизм образования прозрачен: ср. «масловар», «медовар», «пивовар» — все они дали фамилии.

Стоит заметить, что написание через «а» (Саховаров) — нормативное, от диалектного произношения слова «сахар» (с аканьем). В дореволюционных документах могла встречаться форма «Сахароваров», но она не прижилась из-за громоздкости. Таким образом, Саховарова — фамилия, прямо указывающая на предка-сахаровара, мастера по варке сахара, что было делом редким и уважаемым в доиндустриальной России.