Фамилия Сакпусунова — редкий случай, когда географическое происхождение просматривается почти однозначно, а вот смысл основы ускользает. Суффикс -ов- указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — сын или потомок Сакпусуна. Однако основа Сакпусун- явно не славянская и не тюркская в привычном для Поволжья виде. Наиболее вероятно, что фамилия калмыцкая или ойратская. В калмыцком языке слово «сак» (sak) означает «беречь», «стеречь», «охранять», а «пусун» (busun) — «другой», «иной». Вместе «сакпусун» могло означать прозвище «берегущий чужое» или, что правдоподобнее, «страж другого» — возможно, так называли телохранителя, доверенного слугу или человека, отвечавшего за имущество в роду.

Модель образования фамилии нехарактерна для исконно русских земель. В русском языке фамилии на -ов образуются от мужских имён и прозвищ, оканчивающихся на согласный. Здесь основа Сакпусун- заканчивается на -н, поэтому -ов- присоединился по общему правилу, вытеснив возможный калмыцкий суффикс принадлежности (например, -ин). Это говорит о том, что фамилию русифицировали при записи в метрические книги или при переписях, когда носитель переходил в православие или оседал среди русского населения. Женская форма Сакпусунова — не исходная, а производная от мужской Сакпусунов, по правилам русского рода.

Другие версии менее убедительны. Можно предположить, что в основе лежит тюркское «сак» (осторожный, бдительный) и «бусун» (опора, столб) — тогда прозвище означало бы «надёжный страж». Но калмыцкая этимология точнее ложится на фонетику: «сак» и «пусун» — устоявшиеся корни, а в тюркских языках «бусун» встречается реже и в ином значении.

По сословному составу предки Сакпусуновых, скорее всего, относились к казачеству или крестьянству южных степных губерний — Астраханской, Ставропольской, Области Войска Донского. Калмыки и ойраты активно служили в иррегулярных войсках, получали земельные наделы и постепенно переходили на русские фамилии. Фамилия не дворянская: в родословных книгах она не зафиксирована, а в справочниках по истории русского дворянства отсутствует.

География бытования узкая. По данным современных телефонных справочников и баз ЗАГС, Сакпусуновы встречаются в основном в Республике Калмыкия, а также в Волгоградской и Ростовской областях — то есть на территориях исторического расселения калмыков. За пределами этих регионов фамилия практически не встречается, что подтверждает её локальный степной корень.

Однокоренных фамилий в русском языке нет. Сравнение с фамилиями Сакпаев, Сакпин, Пусунов показывает, что Сакпусунова стоит особняком: она сохранила двусоставную основу целиком, без усечения. Это редкая черта — обычно сложные прозвища при русификации сокращаются или переосмысляются. Здесь же форма осталась архаичной, что делает фамилию ценным свидетельством контакта калмыцкого и русского языков в XVIII–XIX веках.