Фамилия Сакупов — редкий случай, когда основа не даёт однозначного ответа и заставляет выбирать между двумя совершенно разными корнями. В ней отчётливо выделяется тюркский пласт, но какой именно — вопрос географии и истории семьи.

Самый прямой путь — от тюркского личного имени Саку́п. В ряде тюркских языков (например, в казахском, башкирском, татарском) корень «сак-/саг-» означает «осторожный», «бдительный», «берегущий». Имя Сакуп или Сакып могло даваться ребёнку с пожеланием быть осмотрительным, а фамилия Сакупов — это русская модель патронимии: «чей?» — «сын Сакупа». Суффикс -ов здесь самый ходовой для адаптации тюркских имён в русской среде, особенно у татар, башкир и казахов, перешедших на русское делопроизводство.

Есть и вторая, менее очевидная, но исторически возможная версия — от арабского «сакиб» (пронзающий, пробивающий). В средневековых мусульманских именниках встречается имя Сакиб со значением «звезда» (как пронзающая тьму). Через тюркское посредничество оно могло дать форму Сакуп, а затем и фамилию. Правда, эта версия сложнее: арабское «сакиб» — редкость для русских фамилий, тогда как тюркское «сак-/саг-» встречается куда чаще и даёт много однокоренных фамилий (Сагитов, Саков, Сакулин).

Географически Сакуповы тяготеют к Волго-Уральскому региону и Западной Сибири. Если ваши предки родом из Оренбуржья, Башкортостана или Татарстана, скорее всего, фамилия образована от прозвища или имени, связанного с осторожностью. Встречаются Сакуповы и у казахов, но там суффикс -ов часто появлялся при записи в метрики в XIX веке, заменяя традиционное окончание -улы/-кызы.

Что интересно: в русском языке фамилия звучит как притяжательное прилагательное (чей? — Сакупов), но исходное имя Сакуп не имеет ничего общего с русским глаголом «сажать» или словом «сакля». Это чисто тюркское образование, и попытки вывести его из славянских корней — лингвистическая натяжка.