Фамилия Самибаев — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или арабо-персидская, но оформлена по русской словообразовательной модели. Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Самибаев, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Самибай.

Разбираем основу. Имя Самибай составное. Первая часть — Сами — восходит к арабскому имени Сами (Sami), которое означает «возвышенный», «всеслышащий» (один из эпитетов Аллаха). В тюркских языках это имя распространено в разных вариантах. Вторая часть — бай — классический тюркский титул, означающий «богач», «господин», «хозяин». В составе личных имён (например, Садыкбай, Асанбай) бай часто превращалось из социального статуса в просто уважительный компонент имени. Таким образом, Самибай — это «господин Сами» или «возвышенный богач».

Географически фамилия Самибаев тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркские и мусульманские традиции: Казахстан, Киргизия, Узбекистан, а также Башкортостан и Татарстан. В русских документах XIX — начала XX века такие фамилии фиксировались у выходцев из этих областей при переселении или поступлении на службу. Сословно предки Самибаева могли быть и зажиточными скотоводами, и сельскими старостами, и торговцами — компонент «бай» в имени не гарантирует огромного богатства, но указывает на определённый вес в общине.

Стоит учесть, что фамилия Самибаев могла возникнуть и как русифицированная форма отчества. В метрических книгах или ревизских сказках человека могли записать как «Самибай», а его сына — «Самибаев». Вторая, менее вероятная версия, — связь с арабским корнем «сами» (высокий) напрямую, без имени Сами, но тогда форма была бы скорее Самбаев или Самбай. Наличие полного гласного «и» между «Сам» и «бай» поддерживает именно версию о составном личном имени.

В отличие от массовых русских фамилий на -ов, Самибаев сохраняет прозрачную этимологию и не уходит в глубину веков: его формирование относится к периоду активного взаимодействия русской административной системы с тюркскими народами, примерно к XVIII—XIX векам.