Фамилия Самтакова — редкий случай, где географический корень почти наверняка перевешивает антропонимический. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная от названия реки Самта (или Самтка) в Грузии, точнее, в исторической области Сванетия. Река Самта (Самтка) — приток Ингури, и в этом регионе фамилии на -ава/-иа, а также их русифицированные варианты, встречаются часто. Однако здесь мы видим не грузинский суффикс, а русский -ов, адаптированный к окончанию на -а. Фамилия Самтаков (и женская форма Самтакова) могла возникнуть у выходцев из села или местности, связанной с этой рекой, при переселении в русскоязычную среду.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от географических названий, прозвищ или личных имен. В данном случае основа «Самта» — это топоним, а не личное имя. Прямых параллелей с тюркскими или иранскими корнями, которые иногда дают похожие звучания (например, «сам» — «равный» в персидском), для этой фамилии практически нет: слишком специфична привязка к кавказскому региону.

Вторая, менее вероятная версия — происхождение от прозвища Самтак, которое могло быть связано с диалектным словом «самтать» (в некоторых говорах — «шататься», «болтаться без дела»). Но это предположение слабое: слово не зафиксировано в авторитетных словарях как распространенное, а сама фамилия крайне редка и не имеет широкого бытования в центральных областях России. Если бы прозвище было основой, мы бы ожидали большего числа носителей в разных регионах, чего нет.

Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение — фамилия Самтакова ведет происхождение от грузинского топонима, а ее носители — потомки людей, переселившихся из Сванетии или прилегающих районов. Фамилия недворянская, крестьянская или казачья по своему генезису, но точное сословие предков установить без генеалогического исследования невозможно — слишком мало данных по конкретным носителям.