Фамилия Самусикова — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной для описания рода, хотя по происхождению это, конечно, патроним от мужской фамилии Самусиков. Её разгадка лежит в просторечной или диалектной форме крестильного имени.

Основа фамилии — имя Самусь. Это не официальная церковная форма, а народно-бытовой вариант канонического имени Самуил (древнееврейское «услышанный Богом»). В русской традиции такие усечённые формы (Самусь, Самуха, Самуня) были обычны в крестьянской и мещанской среде: полное имя звучало слишком торжественно для повседневного обихода. Суффикс -ик в основе Самусик указывает на ещё одну ступень уменьшительности: Самусь → Самусик («маленький Самусь», возможно, сын или младший член семьи). Модель Самусиков означает «чей?» — сын Самусика.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским говорам, где формы на -ус (Самусь, Демус, Игнатусь) встречаются чаще, чем в северных регионах. Встречается она и у донских казаков, где имя Самуил также было в ходу. Примечательно, что окончание -ова — типично русское, а не украинское (где было бы Самусик), что указывает на адаптацию фамилии в великорусской среде.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия: происхождение от прозвища Самусь, связанного с диалектным глаголом «самусить» — говорить невнятно, бормотать, или «сам» (в значении «свой», «особенный»). Однако ономастика отдаёт предпочтение имени, поскольку прозвищные фамилии с таким корнем единичны, а имя Самуил было широко распространено.

Таким образом, носительница фамилии Самусикова — потомок человека по имени Самуил, которого в быту звали ласково Самусиком. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, и её редкость объясняется тем, что уменьшительная форма «Самусик» не стала общеупотребительной, а осталась локальной семейной традицией.