Фамилия Санаубарова — яркий пример того, как географическая точка превратилась в родовое имя. В её основе лежит топоним Санаубар — название села или местности. Такие фамилии, образованные от названий поселений с помощью суффикса принадлежности -ов, типичны для русской ономастики, но в данном случае исходное слово звучит нехарактерно для славянского уха.

Корень «Санаубар» имеет иранское или тюркское происхождение. Вероятнее всего, он восходит к персидскому «санавбар» (صنوبر) — так называют сосну или пихту, то есть хвойное дерево. В топонимике Кавказа и Средней Азии это слово встречается нередко: например, село Санавбар существует в Узбекистане, а в горных районах Таджикистана есть урочища с похожим названием. Таким образом, предок носительницы фамилии мог получить прозвание «Санаубар» по месту жительства — из села, стоявшего среди соснового леса или носившего имя «Сосновое».

Фамилия закрепилась в мужской форме Санаубаров. Женское окончание -а указывает на то, что перед нами вариант, принадлежащий женщине (жене или дочери Санаубарова). С точки зрения словообразования здесь работает простая модель: географическое название → прозвище или некалендарное имя Санаубар → фамилия Санаубаров. Суффикс -ов стандартно присоединяется к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный.

Встречаемость фамилии невысока. Основной ареал — юг России, особенно Ставропольский край и республики Северного Кавказа, а также Средняя Азия. Это объяснимо: именно в этих регионах чаще всего фиксируются топонимы с корнем «санавбар». Фамилия не имеет отношения к дворянским родам или известным историческим династиям — это крестьянская или мещанская фамилия, возникшая естественным путём в XIX веке, когда крестьянам массово присваивали фамилии по названиям их деревень.

Если сравнивать с однокоренными, то можно вспомнить фамилию Санабаров (с утратой «у») или Санавбаров (с сохранением «в»). Написание через «у» (Санаубарова) — наиболее частый вариант в русской передаче, хотя в оригинале может звучать и как Санавбарова.