Фамилия Санграфова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, нужно отбросить суффикс -ов и посмотреть на основу «Санграф». Сразу бросается в глаза, что это не типичное для русских фамилий слово: в нём нет славянского корня, связанного с ремеслом, животным или внешностью. Вероятнее всего, перед нами искусственное или семинарское образование.

Большинство фамилий на -графов (Географов, Каллиграфов, Хронографов) в России давали в духовных училищах и семинариях. Священники при поступлении нередко получали новую фамилию — звучную, книжную, часто греческую или латинскую по происхождению. «Санграф» — слово, которое можно разобрать как греческое «сан» (священный, от hagios — святой) и «граф» (пишущий, чертящий). В буквальном смысле «священный писец» или «тот, кто пишет святые тексты». Это вполне могла быть фамилия, данная сыну псаломщика или пономаря, который отличался грамотностью и красивым почерком.

Есть и более прозаичная, но менее вероятная версия: прозвище Санграф могло образоваться от искажённого имени или названия ремесла. Например, от диалектного «сан» (сани) и «граф» (в значении «царапающий», «чертящий» — то есть мастер по саням). Однако эта гипотеза слабая, так как слово «граф» в народной речи почти не употреблялось в таком значении, а фамилия явно несёт книжный отпечаток.

В пользу семинарского происхождения говорит и суффикс -ов, который в таких фамилиях часто заменял более типичный для духовенства -ский. Санграфов — это русифицированный вариант: вместо «Санграфский» (как, например, Преображенский) взяли более простую форму по модели крестьянских фамилий. Носители фамилии, скорее всего, были выходцами из духовного сословия, возможно, из центральных губерний России, где семинарии давали такие «учёные» фамилии. Встретить Санграфовых в старых метрических книгах можно в среде причетников и дьячков, а не дворян или купцов.