Фамилия Сантерский — явный представитель «географической» модели на -ский, самой распространённой в польской и западнорусской ономастике. Такие фамилии обычно указывали на место, откуда человек родом или где владел землёй. Основа здесь — топоним Сантеры или близкое к нему название.

Прямой аналог — польские фамилии вроде Сантерский (Sąterski, Sąderski) или более частые Сандецкий, Сондецкий, восходящие к городу Сонч (Nowy Sącz) в Малой Польше. Однако в русском контексте фамилия могла возникнуть и от названия деревни Сантеры — такие встречаются в исторических документах Западного края (современные Беларусь, Украина, Литва). В XIX веке многие шляхтичи и крестьяне, переселяясь вглубь России, получали фамилии по названию покинутого имения или хутора.

Суффикс -ский в русской среде чаще носил дворянский или духовный оттенок: так оформлялись фамилии выходцев из шляхты и семинаристов. Но Сантерский мог попасть и в крестьянскую среду через перепись — если предок происходил из местечка Сантеры, его записывали по месту выхода. Вторая версия, менее вероятная, — от прозвища Сантер, которое могло быть связано с диалектным «сантерить» (болтать, пустословить) в некоторых южнорусских говорах, но тогда ожидалась бы фамилия Сантеров.

Самая правдоподобная гипотеза: фамилия образована от названия населённого пункта вроде Сантеры, Сантарск или Сантарово. В дореволюционных метрических книгах носители фамилии встречаются преимущественно на западе Российской империи — в Гродненской, Минской, Волынской губерниях. Это косвенно подтверждает версию о польско-литовском происхождении.

Искать точное место, давшее фамилию, можно в старых географических справочниках. Например, в «Списке населённых мест Российской империи» за 1860–1880-е годы упоминаются фольварки и селения Сантеры в Виленской и Ковенской губерниях. Если ваш предок происходил оттуда, фамилия буквально говорит: «тот, кто из Сантер».