Фамилия Санжурин — редкий случай, когда в основе лежит не славянское имя или прозвище, а тюркское или монгольское личное имя. Корень «Санжур» восходит к восточному имени Санджар, которое в свою очередь происходит от древнетюркского «санжар» — «пронзающий», «колющий», в переносном смысле «острый», «решительный». В истории это имя носил сельджукский султан Ахмад Санджар, правивший в XII веке, что придаёт фамилии неожиданный исторический вес. Форма Санжур — это один из вариантов адаптации этого имени в русской среде, где конечный «-ар» мог перейти в «-ур» под влиянием местных говоров или просто как фонетическое упрощение.

Суффикс «-ин» указывает на модель образования от личного имени или прозвища: Санжур — Санжурин, то есть «сын Санжура» или «принадлежащий Санжуру». Это типичная русская патронимическая модель, которая в XV–XVII веках закреплялась за крестьянами и служилыми людьми, особенно в районах активных контактов с тюркскими народами. Географически фамилия Санжурин встречается в Поволжье, на Урале и в Западной Сибири — регионах, где пересекались русские, татарские и башкирские роды. Не исключено, что предок-носитель имени Санжур был выходцем из татарской или башкирской среды, принявшим православие, или же русским, получившим тюркское прозвище за характер или внешность.

В русском контексте фамилия не имеет связи с каким-либо ремеслом или географическим названием — она целиком восходит к личному имени. Из-за редкости нет данных о массовом бытовании в дворянских или купеческих списках; скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия, зафиксированная в метрических книгах отдельных селений. Встречаются варианты написания Санжуров и Санджурин, но форма с «-ин» остаётся основной. Для носителя фамилии Санжурин это, вероятно, единственная ниточка к предку, чьё имя звучало как вызов — «пронзающий».