Фамилия Сайбонова — женская форма фамилии Сайбонов, и её происхождение ведёт нас не в славянскую, а скорее в тюркскую или монгольскую языковую среду. Основа фамилии — мужское имя или прозвище Сайбон. В тюркских языках, особенно в казахском, башкирском и татарском, «сай» означает «выбирать», «отбирать», а также может быть частью сложных имён со значением «хороший», «лучший». Компонент «бон» или «бон» в тюркских именах часто восходит к слову «бек» (князь, господин) или к древнему титулу «бон» (глава, вождь). Таким образом, Сайбон — это «избранный господин» или «лучший предводитель».

Суффикс -ов/-ов в фамилии Сайбонов — стандартный русский патронимический суффикс, который присоединялся к нерусским основам при оформлении фамилий в документах. То есть изначально Сайбонов — это «сын Сайбона». Женская форма Сайбонова образована по тому же правилу: «дочь/жена Сайбонова».

Интересно, что фамилия Сайбонова — довольно редкая. В России она встречается преимущественно в Поволжье и на Урале, а также среди башкирского и татарского населения. Встречаются варианты написания: Сайбанова, Сайбонов, но форма с буквой «о» — основная. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Сайбонова стоит в одном ряду с Сайфуллин, Сайдашев, Сайранов — все они образованы от тюркских имён с корнем «сай-».

Каких-либо документальных свидетельств о конкретном родоначальнике или дворянском роде Сайбоновых в открытых источниках нет. Скорее всего, предки носителей фамилии были крестьянами или ремесленниками, получившими фамилию при переписях населения в XVIII–XIX веках, когда русская администрация активно «обрусивала» имена и прозвища нерусских народов. Так что фамилия Сайбонова — это осколок тюркской антропонимики, вшитый в русскую фамильную модель.