Фамилия Сайнахова — женская форма фамилии Сайнахов, и её происхождение напрямую связано с регионом Северного Кавказа, скорее всего, с Ингушетией или Чечнёй. Основа фамилии — мужское имя Сайнах (варианты: Сайн, Саин), которое в тюркских и кавказских языках восходит к арабскому «са’ид» — «счастливый», «удачливый», «благополучный». В ингушском и чеченском языках это имя могло адаптироваться как Сайнах, где «накх» или «нах» — суффикс принадлежности или уменьшительно-ласкательный элемент, характерный для местной ономастики.

Суффикс -ов/-ев в фамилии Сайнахов указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии при вхождении кавказских народов в состав Российской империи в XIX веке. Документы, переписи и военные списки нередко русифицировали горские имена и прозвища, добавляя типичные окончания. Таким образом, Сайнахов — это «сын (или потомок) Сайнаха», где исходное прозвище или имя указывало на человека, которого считали счастливчиком или удачливым.

Географически фамилия Сайнахова встречается в основном среди ингушей и чеченцев, особенно в горных и предгорных районах Ингушетии (например, селения Джейрах, Таргим). Встречается и у осетин-дигорцев, что объясняется давними культурными и брачными связями между народами. В русскоязычной среде фамилия редка и чаще всего фиксируется у потомков выходцев с Кавказа.

Интересно, что в некоторых говорах имя Сайнах могло быть не личным, а прозвищем, данным за характер или внешность: «сайн» в тюркских языках означает «красивый», «хороший», так что Сайнахова — это фамилия «красивого» или «доброго» человека. Однако арабская версия с корнем «счастье» выглядит более убедительной, учитывая распространённость исламских имён на Кавказе.