Фамилия Саюпов образована по самой распространённой в русском языке модели — с помощью патронимического суффикса -ов. Однако её основа не славянская, а тюркская, что сразу указывает на круг возможных предков носителя.

В основе лежит личное имя Саюп. Это один из вариантов произношения арабского имени Айюб (библейский Иов). В тюркских языках, особенно в башкирском, татарском, казахском, начальный звук «а» часто редуцируется или переходит в «с» под влиянием местной фонетики. Таким образом, Саюп — это адаптированная форма имени пророка, известного своим терпением и праведностью. Суффикс -ов показывает, что фамилия означает «сын (или потомок) Саюпа».

Географически фамилия Саюпов распространена в основном среди башкир и татар. В башкирском ономастиконе она встречается часто, особенно в южных и зауральских районах. Встречается она и у казахов, но там чаще пишется как Саюпов или Саюп (без суффикса). В русском контексте фамилия закрепилась, скорее всего, в XIX веке, когда у башкир и татар начали массово фиксировать фамилии по отчеству.

Интересная деталь: в отличие от русских фамилий на -ов, которые часто происходят от мирских или крестильных имён, здесь мы видим прямое заимствование из коранической традиции. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был мусульманином и имя получил по религиозному канону. Встречается и вариант написания Саюппов (с двумя «п»), но он редок и, вероятно, возник из-за ошибки в документах или под влиянием произношения с удвоением согласного.