Фамилия Сечунов не самая распространённая, и её происхождение, скорее всего, не связано с каким-то одним очевидным корнем. В ней слышится отголосок диалектного слова или прозвища, а разобраться помогает суффикс -ов, который указывает на отчество: Сечун → сын Сечуна. Значит, в основе лежит личное прозвище Сечун.

Самая прямая версия отсылает к глаголу «сечь» — рубить, резать, хлестать. Сечуном могли прозвать человека с резким, рубящим характером, прямолинейного и бескомпромиссного. В северных и сибирских говорах «сечун» — это не только тот, кто сечёт, но и холодный, пронизывающий ветер. Такое прозвище могли дать суровому, неулыбчивому человеку или тому, кто работал на открытом воздухе в любую погоду.

Есть и другая, менее очевидная, но возможная версия. В украинском языке «січун» (произносится «сичун») — название месяца января или февраля, времени «сечи» (вырубки леса). Если предки носителя фамилии были выходцами с юга России или Украины, прозвище могло быть календарным: Сечуном называли ребёнка, родившегося в лютый зимний месяц.

Суффикс -ун в прозвище (как в словах «крикун», «молчун») придаёт оттенок деятеля, склонного к определённому действию или состоянию. Сечун — не тот, кто однажды что-то порубил, а тот, кто постоянно «сечёт»: либо характером, либо ремеслом (например, лесоруб, мясник), либо жизненной позицией.

Фамилия встречается в центральных областях России и на юге, но нигде не образует плотных гнёзд. В дореволюционных переписях Сечуновы — чаще крестьяне или мещане, без привязки к дворянским родам. Это фамилия, которая сохранила в себе живое прозвище, а не книжное или церковное имя.