Фамилия Сеины — редкий случай, когда за привычным русским окончанием угадывается не славянская, а финно-угорская основа. Вопреки ожиданию, корень здесь не от глагола «сеять» и не от имени Семён в его краткой форме. Скорее всего, в основе лежит мордовское слово «сея» — так называли козу, козла или барана. Это прямо указывает на прозвище или личное имя, которое дали предку, и от него уже пошла фамилия по стандартной модели: имя Сея + русский притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — «сын Сеи».

Сама традиция называть людей именами животных уходит в глубокую древность. У финно-угорских народов выбору имени придавали сакральное значение: отец младенца мог выйти на улицу, и первое, что он видел — предмет, птицу или зверя, — становилось именем новорождённого. Логика была проста и практична: раз эта вещь или существо существует и здравствует, то и ребёнок, названный в его честь, будет жить в достатке и благополучии. Так что человек по прозвищу Сея мог быть совсем не похож на упрямого козла — имя скорее служило оберегом, пожеланием жизненной силы.

Интересно, что фамилия встречается в документах начала XX века в самых разных, удалённых друг от друга регионах. Например, в метрических записях упоминаются Сеин Иван Михайлович, родившийся в 1914 году в Краснодарском крае, Сеин Кузьма Сергеевич (1872 года рождения) и Сеин Пётр Борисович, появившийся на свет в 1877 году в Ханты-Мансийском округе. Такая география не случайна: она отражает миграционные потоки мордовского населения, которое расселялось по всей империи, а также последующие перемещения людей в советское время. Поэтому, хотя фамилия и сохранила память о финно-угорских корнях, привязать её к одной конкретной деревне или точной дате возникновения без серьёзных генеалогических изысканий невозможно. Процесс формирования каждой отдельной ветви рода мог идти своим путём, и окончательную точку в истории конкретной семьи Сеиных может поставить только изучение архивных документов.