Фамилия Секошин — одна из тех, где корень сразу не прочитывается, а суффикс даёт подсказку. Основа здесь — «Сек-», а суффикс «-ошин» указывает на характерную модель образования.

Чаще всего фамилии на «-ошин» (как Фомошин, Мамошин) происходят от разговорных форм крестильных имён. В основе «Секошин» может лежать имя Сек — это народная, усечённая форма от полного имени Секонт (редкое греческое имя, означающее «второй»). В русском быту такие сокращения были обычны: длинное имя резали до одного-двух слогов, а потом добавляли фамильный суффикс. Получалось: Сек → Сек-оша → сын Секоши → Секошин.

Есть и вторая версия, более прозаическая. В северных говорах, особенно в архангельских и вологодских, слово «секоша» означало «сечка», «мелко нарубленная солома» или «корм для скота». Прозвище Секоша могли дать крестьянину, который рубил солому, или человеку с резким, рубленым характером. Такие прозвища по ремеслу — частый источник фамилий, но здесь важно, что суффикс «-оша» в прозвищах встречается реже, чем в уменьшительных формах имён.

Фамилия редкая. Встречается в основном на северо-западе России и в Поволжье, что косвенно поддерживает обе версии: и северные говоры, и традиция крестильных имён там были сильны. Сословного барьера у фамилии нет — её могли носить и крестьяне, и мещане.

Если выбирать между версиями, первая (от имени Сек) кажется более надёжной. Модель «имя + -оша + -ин» — типовая для русских фамилий XVI–XVII веков, а прозвищная версия требует допущения, что прозвище на «-оша» закрепилось именно в этом значении. Но обе гипотезы имеют право на существование, и без архивных записей по конкретной семье окончательный ответ дать сложно.