Фамилия Сэмчышын — редкий случай в русском ономастиконе. Её звуковой облик и структура сразу выдают нерусское происхождение: сочетание «чышын» нехарактерно для славянских фамилий, а ударение, скорее всего, падает на последний слог. Это одна из фамилий, которые возникли у народов Северного Кавказа или Закавказья, но получили русское оформление.

Словообразовательная модель фамилии — русский суффикс -ын, который в исконных фамилиях указывает на принадлежность (чей? → Сэмчышын). Однако основа «Сэмчыш» не имеет славянских корней. Скорее всего, это русифицированная запись адыгской (черкесской), абхазской или, возможно, тюркской фамилии. В адыгских языках распространены фамилии на -ыпш, -ху, -у, но звук «ч» и сочетание «ышын» встречаются в личных именах и прозвищах. Например, у адыгов есть мужское имя Сэмч (вариант от Сэмэт — «вечный» или от арабского «самт» — молчание), а «чышын» может означать «сын» или указывать на место жительства. Таким образом, Сэмчышын могло означать «сын Сэмча» или «из рода Сэмч».

Другая версия отсылает к тюркским языкам, где «семчи» — это стрелок из лука или лучник (от «сэм» — стрела). В таком случае фамилия могла быть прозвищем профессионального воина, а окончание -ын добавили при записи в русских метрических книгах. Слабость этой гипотезы в том, что тюркские фамилии чаще оформляются суффиксом -ов/-ев, а не -ын.

Географически фамилия Сэмчышын почти не встречается за пределами Кавказа. По открытым данным, её носители сосредоточены в Краснодарском крае и Адыгее, что подтверждает адыгскую версию происхождения. В дореволюционных списках фамилия могла записываться как Семчишин, Семчишев или Сэмчишев — вариации возникали из-за слухового восприятия при переписях.

Из-за малочисленности фамилии сложно судить о сословной принадлежности предков. Скорее всего, это были вольные крестьяне или воины-дворяне (у адыгов — уорки), так как многие адыгские фамилии ведут начало от знатных родов. Но точных данных нет — фамилия не попала в сводные ономастические словари Унбегауна или Никонова. Единственное, что можно сказать с уверенностью: Сэмчышын — это маркер этнической и региональной истории, связывающий носителя с кавказским миром.