Фамилия Семннушенков — редкий случай, когда ошибка в написании, скорее всего, закрепилась в документах. Вероятнее всего, перед нами искажённый вариант фамилии Семенущенков или Семёнущенков. Двойное «нн» в корне и лишняя буква «н» в середине — типичная описка при записи в паспортном столе или переписи, когда писарь механически удвоил согласную, услышав мягкое «н» в беглой речи. Поэтому разбирать нужно исходную, правильную форму.

Основа фамилии — имя Семён (каноническая форма Симеон, от древнееврейского «шема» — «услышанный Богом»). Суффикс -ущенк- — это сложный словообразовательный элемент. В нём соединились два суффикса: -уш- (уменьшительно-ласкательный, как в Семушка) и -енк- (украинский или южнорусский патронимический суффикс, означающий «сын», «потомок»). Таким образом, Семенущенков буквально означает «сын Семёнушки», то есть внук или правнук человека, которого в семье ласково звали Семёнушкой.

Географически фамилии на -енко и их производные на -енков характерны для юга России и Украины. Семенущенковы, вероятно, происходят из крестьянской или казачьей среды Курской, Воронежской, Белгородской губерний или Слобожанщины. В XIX веке при переселении крестьян на новые земли или при записи в рекруты фамилию могли «обрусить», заменив украинское окончание -енко на русское -енков, что и дало современный вид.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает понять редкость формы. Есть Семёнов (самый частый вариант), Семенченко, Семенюк, Семеновский. А вот Семенущенков стоит особняком: двойной уменьшительный суффикс — признак того, что предка очень выделяли в семье, возможно, он был младшим или долгожданным ребёнком. Если ваш нынешний паспорт пишется через три «н» — Семннушенков — это, скорее всего, ошибка переписчика начала XX века, которую исправлять или оставить, решать вам, но исторически верное написание — Семенущенков.