Фамилия Септилко — редкий случай, когда в основе лежит не прозвище, не ремесло, а личное имя, причём не славянского, а латинского корня. В её центре — имя Септил, которое восходит к латинскому «septimus» — «седьмой». В Древнем Риме это было распространённое личное имя (Септимий, Септимус), которое давали седьмому ребёнку в семье. Через христианскую традицию, в том числе через почитание святых (например, священномученика Септимия), имя попало в православные святцы, хоть и осталось редким.

Суффикс «-ко» — типичный украинский или белорусский уменьшительно-ласкательный формант. Он активно использовался для образования фамилий в XVI–XVIII веках на территориях современной Украины, юга Беларуси и юго-запада России. В этой модели фамилия Септилко означает буквально «маленький Септил» или «потомок Септила». То есть предок носителя фамилии был либо сыном человека по имени Септил, либо сам носил это имя, которое затем закрепилось за его родом.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским и польским землям. Встречается в архивных записях Волынской, Подольской и Киевской губерний XIX века. Встречается также вариант написания Септылко — с «ы» вместо «и», что отражает местное произношение или диалектные особенности. В польском языке фамилия могла бы выглядеть как Septylko, но в русскоязычной среде закрепилась именно форма Септилко.

Интересно, что фамилия не получила широкого распространения, что типично для имён латинского происхождения в славянской среде: они бытовали в основном среди духовенства или мелкой шляхты, которые чаще обращались к календарным именам. Однако Септилко — не семинарская фамилия (их обычно образовывали от полных форм — Септимов, Септимиев), а скорее народная, крестьянская или казацкая, где редкое имя адаптировали по простонародной модели с суффиксом «-ко». Таким образом, Септилко — это живое свидетельство того, как латинское имя через церковный календарь дошло до украинского села и закрепилось в фамилии.