Фамилия Сесютченкова — редкая и морфологически прозрачная. Перед нами женская форма фамилии на -ов, образованная от мужской Сесютченков. В основе лежит прозвище или неканоническое имя Сесютка, которое, в свою очередь, возникло от глагола «сесюкать» или звукоподражательного «сю-сю». В русских говорах «сюсюкать» означало шепелявить, картавить или вообще нечисто выговаривать слова, а также — сюсюкаться, то есть нежно, по-детски ворковать с кем-то. Соответственно, Сесюткой могли прозвать человека с невнятной речью, шепелявого, либо, наоборот, того, кто любил сюсюкать, говорить ласково, приторно.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -к- (Сесют-к-а) указывает на лицо, а затем суффикс -енков (Сесют-к-енков) — на принадлежность или происхождение. Суффикс -енков (вариант -онков) особенно характерен для фамилий, сложившихся в южновеликорусских и украинских землях. Он означает «сын такого-то»: Сесютченков — буквально «сын Сесютки». В отличие от более северного -ов/-ев, форма на -енков широко бытовала в Черноземье, на Дону, в Поволжье, а также среди казачества. Таким образом, предки носительницы фамилии, скорее всего, происходили из этих регионов и были крестьянами, мещанами или казаками — людьми, чьи прозвища легко закреплялись в документах.

Ударение, судя по звучанию, падает на второй слог: Сесю́тченкова. Встречаются и варианты написания с одной «с» в корне (Сесютченков), но с точки зрения этимологии это не принципиально — корень «сес-» восходит к тому же «сюсю». Родственные фамилии — Сюсюкин, Сюсюкалов, Сесюнин — все они образованы от разных форм одного и того же глагола или звукоподражания. В отличие от многих прозвищных фамилий, значение здесь не утрачено и читается прямо: фамилия сохранила память о речевой особенности или манере поведения предка.